產品介紹
原核有參轉錄組測序是針對細菌等原核生物，利用高通量測序技術對其轉錄的mRNA進行測序分析，并結合已知的參考基因組信息，開展基因表達定量、差異表達分析、功能注釋等研究的技術手段。它能高效解析原核生物在特定生理狀態、環境脅迫或發育階段下的基因表達調控規律。
技術優勢
? 準確性高：依賴已知的參考基因組，序列比對和基因注釋更可靠，減少假陽性結果。
? 數據利用率高：特異性去除rRNA，高效富集mRNA，顯著降低 rRNA 污染，避免無效數據浪費
? 鏈特異性文庫：可提供準確的基因表達定量信息、精準解析操縱子與轉錄邊界、鑒定反義RNA等調控因子、排除gDNA污染干擾
樣本要求
無致病性的細菌沉淀 | ≥200 mg；或對數期1ml菌液離心得到的沉淀 |
植物組織 | 總量≥2 μg，濃度≥50 ng/μL，體積≥40 μL |
檢測平臺
Illumina NovaSeq X Plus、DNBSEQ-T7
應用方向
? 環境適應機制研究：分析原核生物在極端環境（高溫、高鹽、重金屬）、營養脅迫下的差異表達基因，揭示其耐逆相關的功能基因和調控通路。例如，研究大腸桿菌在饑餓條件下的碳代謝基因表達變化
? 病原菌致病機制解析：對比病原菌在感染宿主前后、毒力菌株與減毒菌株的轉錄組差異，篩選毒力基因、黏附相關基因等，闡明致病分子機制。例如，研究金黃色葡萄球菌在人體血液中的基因表達特征
? 抗生素耐藥性研究：分析耐藥菌株與敏感菌株在抗生素處理后的轉錄組變化，挖掘耐藥基因（如耐藥泵基因、靶標基因突變相關基因）及耐藥調控網絡
? 工業微生物改造：針對產酶菌、產抗生素菌等工業菌株，通過轉錄組分析篩選高產相關基因，指導菌株基因工程改造。例如，優化放線菌的抗生素合成通路基因表達
案例應用
1. Isolation and characterization of Pseudomonas fluorescens producing biogenic amines: AHL-mediated quorum sensing as a key regulatory mechanism.2025.LWT【IF=6.6】
2. Integrated induction of silver resistance determinants and production of extracellular polymeric substances in Cupriavidus metallidurans BS1 in response to silver ions and silver nanoparticles.2024.Chemosphere.【IF=8.1】
原核轉錄組測序綜合解決方案，數據分析軟件，質譜檢測技術及介紹，全面的聯用技術等。
