2025年4月，nature metabolism重磅發(fā)聲：代謝物不是基因——警惕代謝組中通路分析的錯(cuò)誤使用！
在生命科學(xué)邁入“多組學(xué)時(shí)代"的今天，代謝組學(xué)因其貼近生理狀態(tài)、精準(zhǔn)描繪表型變化而備受關(guān)注。尤其在疾病機(jī)制解析、臨床轉(zhuǎn)化、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)、新藥篩選、微生態(tài)研究等領(lǐng)域，代謝組學(xué)正逐漸成為不可或缺的研究工具。
其中代謝通路分析，是代謝組學(xué)數(shù)據(jù)解讀的“黃金步驟”，是連接代謝物變化與生物機(jī)制的核心橋梁——但我們始終需警惕一個(gè)靈魂拷問(wèn)：代謝物濃度升高，是否能代表整個(gè)通路被激活？富集顯著的通路，真的“被調(diào)控”了嗎?
nature metabolism文章指出，直接將“富集P值+通路顯著性”照搬到代謝組，是非常危險(xiǎn)的行為，可能會(huì)得出誤導(dǎo)性結(jié)論或掩蓋真實(shí)機(jī)制。
代謝物是通路的“結(jié)果”，不一定反映因果。它的升高有可能是下游阻斷、也可能是運(yùn)輸障礙。例如乳酸升高并不等同于糖酵解增強(qiáng)，實(shí)際上可能是線粒體功能受損，丙酮酸無(wú)法進(jìn)入TCA循環(huán)，被迫轉(zhuǎn)化為乳酸。
所以研究者建議代謝組學(xué)研究應(yīng)該從“濃度”向“通量”過(guò)渡，建議發(fā)展代謝流分析(metabolic flux analysis)、同位素示蹤等方法觀察通路真實(shí)走向，而非僅憑濃度猜測(cè)。
深耕科研賦能，解鎖代謝真相！百趣生物重磅升級(jí)靶標(biāo)代謝流檢測(cè)分析技術(shù)，由30+物質(zhì)的檢測(cè)列表提升至140+物質(zhì)的檢測(cè)列表，覆蓋糖酵解(EMP)、TCA循環(huán)、磷酸戊糖途徑(PPP)、核苷酸代謝等多條代謝途徑，可全面研究臨床、動(dòng)物、植物樣本中代謝通量隨時(shí)間變化的動(dòng)態(tài)規(guī)律，準(zhǔn)確分析流經(jīng)代謝途徑的代謝流量，清晰闡釋代謝物在代謝途徑中的變化機(jī)制，進(jìn)而將代謝組學(xué)研究提升到更高水平。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
實(shí)現(xiàn)同位素追蹤
基于13C標(biāo)記的碳代謝流分析
基于15N標(biāo)記的氮代謝流分析
能量代謝通路覆蓋廣
一次性可檢測(cè)140+與能量代謝相關(guān)物質(zhì)
涵蓋糖酵解、TCA循環(huán)、PPP三條中心碳代謝通路
包括氨基酸代謝、核苷酸代謝、嘌呤代謝、嘧啶代謝等多條能量代謝相關(guān)通路
應(yīng)用方向
靶標(biāo)代謝流Pro可以廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)和生物醫(yī)藥領(lǐng)域，具體包括疾病診斷、預(yù)后評(píng)估、藥物臨床研究、植物色澤品質(zhì)、植物非生物脅迫等研究方向。
基因工程
提高基因工程菌目標(biāo)代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量；研究基因改造前后的代謝功能變化。
疾病機(jī)理
揭示腫瘤代謝抑制劑個(gè)性化治療機(jī)制；發(fā)現(xiàn)疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程早期診斷的標(biāo)志物。
代謝重編程
研究炎癥性巨噬細(xì)胞免疫代謝重編程機(jī)制；探索植物葉綠體代謝重編程機(jī)制。
樣本建議量
細(xì)胞： 1×10? cells/sample
類器官：100 mg/sample
組織： 100 mg/sample
液體： 200 μL/sample
如果您的課題涉及代謝功能變化及代謝調(diào)控機(jī)制，百趣生物靶標(biāo)代謝流Pro檢測(cè)將會(huì)為您提供堅(jiān)實(shí)可靠的數(shù)據(jù)支持。歡迎后臺(tái)留言咨詢，我們期待為您的科研工作保駕護(hù)航~
參考文獻(xiàn)
Lee KS, Su X, Huan T. Metabolites are not genes - avoiding the misuse of pathway analysis in metabolomics. Nat Metab. 2025 May;7(5):858-861. doi: 10.1038/s42255-025-01283-0IF: 20.8 Q1 . PMID: 40211046.
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