產(chǎn)品介紹
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單個(gè)細(xì)胞水平進(jìn)行高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù)，能夠有效解決細(xì)胞異質(zhì)性以及bulk RNA-seq被掩蓋的細(xì)胞群內(nèi)轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性難題，有助于發(fā)現(xiàn)新的稀有細(xì)胞類型，深入了解細(xì)胞生長(zhǎng)過(guò)程中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。利用微流控系統(tǒng)、油包水的微反應(yīng)體系，通過(guò)序列標(biāo)簽（barcode和UMI）區(qū)別群體中的不同細(xì)胞和轉(zhuǎn)錄本，獲得單細(xì)胞水平的基因表達(dá)譜，實(shí)現(xiàn)數(shù)千甚至上萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞群體分析。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
? 高通量：一次可以檢測(cè)8個(gè)樣本，每個(gè)樣本檢測(cè)上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞
? 短周期：6分鐘內(nèi)完成單細(xì)胞捕獲，一天之內(nèi)可完成細(xì)胞懸液制備、單細(xì)胞捕獲、擴(kuò)增及建庫(kù)
? 高捕獲：GEM-X試劑盒捕獲效率高達(dá)80%
? 普適性高：適用于多種樣品類型，根據(jù)關(guān)注的不同細(xì)胞類型，可選擇新鮮組織制備細(xì)胞懸液或者凍存組織抽取細(xì)胞核
樣本要求
樣品類型 | 送樣建議（供參考） | 時(shí)效性 | 運(yùn)輸保存條件 | 注意事項(xiàng) |
人全血 | 4ml | 12h | 4℃，EDTA-K2抗凝管 | 只能使用EDTK-K2抗凝管采集血液樣本 |
小鼠全血 | 1-2ml | 12h | 4℃，EDTA-K2抗凝管 | |
新鮮組織 | ＞200mg | 48h | 4℃，組織保存液 | 血管，軟骨，胰腺和穿刺樣本提前咨詢實(shí)驗(yàn)室 |
細(xì)胞懸液 | ＞50萬(wàn) cells | 4h | 4℃，培養(yǎng)基/含2-10%FBS培養(yǎng)基 | 盡快送至實(shí)驗(yàn)室 |
體液 | ＞10ml | 4h | 4℃ | 盡快送至實(shí)驗(yàn)室，一、原液寄送，二、混合培養(yǎng)基寄送，三、離心后用培養(yǎng)基重懸寄送 |
類器官 | ＞200mg | 48h | 4℃，培養(yǎng)基或組織保存液 | 盡快送至實(shí)驗(yàn)室 |
凍存細(xì)胞 | ＞50萬(wàn) cells | / | -80℃，細(xì)胞凍存液 | 建議干冰15-20kg |
凍存組織 | ＞100mg | / | -80℃ | 建議干冰15-20kg |
檢測(cè)平臺(tái)
10x Genomics Chromium iX、DNBelab C-TaiM4
應(yīng)用方向
? 腫瘤方向：解析腫瘤微環(huán)境中癌細(xì)胞、免疫細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞的異質(zhì)性特征，識(shí)別腫瘤干細(xì)胞、循環(huán)腫瘤細(xì)胞等關(guān)鍵亞群，揭示腫瘤發(fā)生、轉(zhuǎn)移及耐藥的分子機(jī)制
? 發(fā)育生物學(xué)：追蹤胚胎發(fā)育、器官形成過(guò)程中細(xì)胞的分化軌跡，鑒定細(xì)胞命運(yùn)決定的關(guān)鍵調(diào)控基因，構(gòu)建細(xì)胞分化的動(dòng)態(tài)分子圖譜，闡明發(fā)育的時(shí)空調(diào)控規(guī)律
? 免疫機(jī)制：刻畫免疫細(xì)胞（如 T 細(xì)胞、B 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞）的亞型多樣性與功能狀態(tài)，解析免疫細(xì)胞在感染、自身免疫病、腫瘤免疫中的應(yīng)答機(jī)制與細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)
? 神經(jīng)科學(xué)：鑒定大腦及神經(jīng)系統(tǒng)中多樣化的神經(jīng)元與膠質(zhì)細(xì)胞亞型，揭示不同細(xì)胞亞群在神經(jīng)信號(hào)傳遞、神經(jīng)退行性疾病發(fā)生發(fā)展中的作用
? 藥物研發(fā)：基于患者單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行疾病分型，篩選特異性分子標(biāo)志物用于疾病早診與預(yù)后評(píng)估，為靶向治療藥物研發(fā)提供精準(zhǔn)的細(xì)胞靶點(diǎn)與作用機(jī)制依據(jù)。
案例應(yīng)用
1. Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report. 2020. Nature medicine.【IF=87.24】
2. A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment of patients with breast cancer.2021.Nature Medicine【IF=87.24】
3. Molecular architecture of the developing mouse brain.2021.Nature【IF=69.5】
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