產(chǎn)品介紹
基于(13)C或者(15)N標(biāo)記的靶標(biāo)代謝流分析能夠系統(tǒng)地定量細(xì)胞或者組織內(nèi)特定代謝通路代謝網(wǎng)絡(luò)的流量分布及各代謝途徑的相對貢獻(xiàn)，其優(yōu)點(diǎn)是可以利用細(xì)胞內(nèi)代謝物的質(zhì)量同位體信息的分析方法，不但在很多情況下能夠直觀地表明代謝流量的整體走向，而且通過計(jì)算能夠準(zhǔn)確定量地揭示細(xì)胞內(nèi)各個(gè)代謝反應(yīng)的活性，以及深入理解平行反應(yīng)、可逆反應(yīng)等多種復(fù)雜的細(xì)胞內(nèi)代謝過程，直觀揭示細(xì)胞胞內(nèi)的主要活性途徑及各個(gè)途徑的相對貢獻(xiàn)及其分布變化特點(diǎn)，從而鑒定出相關(guān)疾病發(fā)生發(fā)展過程的早期診斷的標(biāo)志物及其關(guān)鍵的主要代謝通路，并揭示其相互調(diào)控規(guī)律，為疾病發(fā)生的臨床早期診斷、藥物靶點(diǎn)治療和預(yù)后判斷提供強(qiáng)有力的科學(xué)依據(jù)。
技術(shù)優(yōu)勢
? 技術(shù)成熟、靈敏度高
? 專業(yè)的數(shù)據(jù)分析團(tuán)隊(duì)，通過Matlab flux-8等軟件進(jìn)行原始數(shù)據(jù)處理，并進(jìn)行PCA、柱狀圖、熱力圖、 Bi-plot等分析
樣本要求
液體 | 100 μL/sample |
組織 | 100 mg/sample |
類器官 | 100 mg/sample |
細(xì)胞 | 1×10? cells/sample |
檢測平臺(tái)
LC-MS/MS
應(yīng)用方向
? 通過比較不同環(huán)境條件及各種代謝性疾病的不同代謝途徑的代謝流量的分布變化，揭示出相關(guān)疾病發(fā)生發(fā)展過程中的主要代謝通路及其早期診斷的標(biāo)志物
? 通過(13)C代謝流量技術(shù)對胞內(nèi)外的中間代謝物的變化示蹤，可以鑒定出基因工程菌的關(guān)鍵的代謝通路和活性，為提高目標(biāo)代謝產(chǎn)物的合成提供直接的依據(jù)
? 可以比較分析細(xì)胞，組織及其血樣和尿液在基因改造的前后的代謝功能變化
案例應(yīng)用
英文標(biāo)題：Development of a high-efficiency N-acetylneuraminic acid production platform through multi-pathway synergistic engineering
發(fā)表期刊：Trends in Biotechnology
影響因子：14.9
研究結(jié)果：該研究團(tuán)隊(duì)通過基因工程改造大腸桿菌，從而實(shí)現(xiàn)對葡萄糖和甘油的高效共利用。研究團(tuán)隊(duì)對兩條起點(diǎn)與終點(diǎn)相同的合成途徑進(jìn)行重構(gòu)，以提高N-乙酰甘露糖胺(ManNAc())前體的水平；同時(shí)，利用人工智能(AI)技術(shù)和機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)序列挖掘方法對N-乙酰神經(jīng)氨酸()(NeuAc)合酶進(jìn)行優(yōu)化。隨后，通過捕獲競爭再生途徑中的碳流來提高磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)的水平，從而平衡胞內(nèi)PEP與ManNAc的比例，以促進(jìn)NeuAc的合成。除葡萄糖外，還研究開通了甘油這一額外碳源輸入途徑，在補(bǔ)料分批發(fā)酵中實(shí)現(xiàn)了70.4 g/l的NeuAc滴度，生產(chǎn)率為1.17 g/l/h。該研究構(gòu)建了用于NeuAc生物合成的高效微生物細(xì)胞工廠，并提供了一種可應(yīng)用于其他高價(jià)值化合物生產(chǎn)的通用系統(tǒng)工程策略。
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